Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms