Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPM2Q86SE8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms