Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC4Q7Z404 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC4Q7Z404 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms