Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS2ST1Q7LGA3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms