Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMUB2Q71RG4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMUB2Q71RG4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms