Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM47EQ6ZV65 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms