Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM43Q6ZSC3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM43Q6ZSC3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms