Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms