Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD4L3Q6VB84 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms