Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCL17Q6UXB2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms