Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TSSK4Q6SA08 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSSK4Q6SA08 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms