Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms