Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCTP1Q6DN14 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCTP1Q6DN14 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms