Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms