Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHEQ5VZ18 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms