Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPRD2Q5VT52 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms