Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf60Q5U649 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf60Q5U649 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms