Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO2Q5TF58 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO2Q5TF58 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms