Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF648Q5T619 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF648Q5T619 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms