Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN11Q5T124 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms