Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEXMIFQ5QGS0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms