Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms