Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR3Q5GH77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms