Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms