Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ISXQ2M1V0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ISXQ2M1V0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms