Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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