Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP35Q16560 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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