Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC1Q15915 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC1Q15915 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms