Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF1Q15361 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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