Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms