Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD1Q15116 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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