Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RFTN1Q14699 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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