Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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NEDD9Q14511 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD9Q14511 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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