Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB33AQ14088 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB33AQ14088 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB33AQ14088 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB33AQ14088 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB33AQ14088 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RAB33AQ14088 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB33AQ14088 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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