Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALCAMQ13740 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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