Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1SQ13698 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1SQ13698 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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