Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTR4Q13639 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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