Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAB1Q13506 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NAB1Q13506 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms