Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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