Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCIRG1Q13488 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCIRG1Q13488 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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