Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LSAMPQ13449 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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