Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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