Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD2Q13200 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD2Q13200 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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