Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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