Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPS1Q13098 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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GPS1Q13098 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPS1Q13098 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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