Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK2Q13002 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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