Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF1Q12946 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF1Q12946 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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