Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TRAF2Q12933 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TRAF2Q12933 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TRAF2Q12933 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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TRAF2Q12933 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TRAF2Q12933 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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