Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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GTF3C1Q12789 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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GTF3C1Q12789 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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GTF3C1Q12789 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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GTF3C1Q12789 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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