Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMGXB3Q12766 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms